52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2326 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  87.84 
 
 		 222 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  87.39 
 
 		 222 aa  341  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  66.67 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  62.31 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  55.22 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  45.5 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  47 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  41.75 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  40.5 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  42.29 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  39.57 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  42.17 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  41.09 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  38.85 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  41.36 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.65 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.12 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.45 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.85 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.5 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  31.31 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.22 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.38 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  28.71 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  29.13 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.64 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  30.73 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  29.65 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  29.19 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.56 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.03 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  31.51 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  26.54 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  27.13 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.5 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.96 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.34 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 		 219 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>