45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0155 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
218 aa  420  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  65.69 
 
 
222 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  65.2 
 
 
222 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  65.2 
 
 
222 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  61.27 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  55.34 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  46.88 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  42.6 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  44.72 
 
 
223 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  41.01 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  40 
 
 
225 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  43.31 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  44.16 
 
 
223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  38.31 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
214 aa  104  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.22 
 
 
221 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.22 
 
 
221 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  43.45 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.5 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.84 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.79 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.72 
 
 
219 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.43 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.84 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.72 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.42 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.24 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.93 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.83 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  26.9 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.63 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  27.18 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  29.23 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.23 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  27.23 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  27.45 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  27.53 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.89 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.17 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.12 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>