135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2434 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  65.85 
 
 
207 aa  272  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  61.24 
 
 
210 aa  263  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  63.18 
 
 
206 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  63.49 
 
 
206 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  63.49 
 
 
226 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  58.67 
 
 
203 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
212 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.02 
 
 
216 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.98 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
213 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
214 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
255 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.07 
 
 
216 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
219 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  34.97 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.62 
 
 
206 aa  92  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  37.98 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  31.28 
 
 
225 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  34.34 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  32.97 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.09 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  35.38 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  34.59 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  35.75 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  34.81 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.92 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  41.03 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.26 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.26 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.39 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  26.9 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  35.97 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.51 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  35.5 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.14 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  35.86 
 
 
234 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.88 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.74 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.71 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.61 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.35 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.58 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.07 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.71 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.54 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.12 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.17 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.53 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.92 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.07 
 
 
220 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.53 
 
 
206 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.55 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  25.85 
 
 
490 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.63 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.41 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  28.24 
 
 
533 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.94 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  28.64 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.32 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.99 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.22 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.34 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  32.85 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.83 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.12 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.12 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.2 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.59 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.5 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.06 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.46 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  29.65 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.94 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  28.7 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0679  thiamine-phosphate diphosphorylase  28.79 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.180423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.41 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.79 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.69 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.6 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.6 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 
344 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.5 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.81 
 
 
212 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.01 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.4 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.85 
 
 
647 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.65 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.62 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.02 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  27.5 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>