47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3535 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  77.56 
 
 		 233 aa  318  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  70.94 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  70.1 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  70.7 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  72.59 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  73.96 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  46.5 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  41.26 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  42.42 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  44.8 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  45.91 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  43.41 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  39.81 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  41.12 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  40.83 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.29 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  33.51 
 
 		 210 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.82 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  35.75 
 
 		 209 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  34.05 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.05 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.46 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  32.81 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.35 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.54 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  30.89 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  34.04 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.9 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.69 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.4 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  27.41 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.23 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.06 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.43 
 
 		 216 aa  42  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.45 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.23 
 
 		 220 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>