62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2647 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  98.65 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  87.84 
 
 		 222 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  65.2 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  60.8 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  53.73 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  44.12 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  41.83 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  39.45 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  41.38 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  41.12 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  40.96 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  37.97 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  38.85 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.66 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  40.7 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.94 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.38 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.94 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.04 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.04 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.02 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.73 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.47 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.08 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  28.44 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  32.85 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.59 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  29.7 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.94 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  28.17 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  27.83 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  31.51 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.3 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.3 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.92 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.29 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.01 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.63 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.54 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.15 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.63 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.63 
 
 		 219 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 		 208 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.03 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.97 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.79 
 
 		 344 aa  41.6  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.97 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>