138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3809 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  87.86 
 
 
206 aa  349  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  87.86 
 
 
226 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  65.84 
 
 
210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  66.83 
 
 
207 aa  277  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  63.18 
 
 
209 aa  256  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  61.22 
 
 
203 aa  234  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.38 
 
 
216 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
213 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
255 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.57 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
214 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  32.07 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  33.68 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  35.16 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.44 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.44 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  31.05 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  34.9 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  29.19 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  30.73 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  41.91 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  30.6 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.24 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  30.89 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.16 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.89 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  28.08 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.46 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.94 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.04 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  30.37 
 
 
490 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  28.12 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.47 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.71 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.72 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.72 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  34.48 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.98 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.4 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.17 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.44 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.42 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.67 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.23 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  33.5 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.19 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.93 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.79 
 
 
204 aa  52  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  26.01 
 
 
183 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.3 
 
 
217 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  25.17 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.9 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.38 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.56 
 
 
217 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.76 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.73 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  29.34 
 
 
497 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.69 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  27.53 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  34.85 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  31.91 
 
 
479 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.09 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.69 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.96 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.72 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
344 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.92 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.16 
 
 
218 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  29.27 
 
 
494 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.56 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.32 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  28.48 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.56 
 
 
352 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.71 
 
 
214 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.56 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  26.95 
 
 
314 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.46 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.11 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.06 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.32 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.9 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  28.71 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.08 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.11 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.53 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.66 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  27.15 
 
 
484 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.56 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.27 
 
 
343 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.47 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.98 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>