More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0994 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0994  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00571546  normal  0.0108418 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  37.67 
 
 
160 aa  104  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.93 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.42 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  35.86 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.9 
 
 
184 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.93 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.51 
 
 
311 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.93 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.06 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  36.3 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.01 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  34.75 
 
 
311 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.25 
 
 
186 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.25 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  32.41 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.99 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.29 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
311 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  31.08 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  35.25 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.47 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
309 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  33.57 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.46 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  32.64 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0442  putative flavin reductase  36.72 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  32.64 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  34.31 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  31.21 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  32.14 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  31.43 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.14 
 
 
161 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  34.31 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.79 
 
 
304 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
168 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  35.81 
 
 
204 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  33.1 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  31.94 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  34.31 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.11 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  33.58 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.51 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.61 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  32 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.46 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.14 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  29.5 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  34.04 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  32.85 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.84 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  29.17 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0350  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6217  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.97 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  32.37 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  29.93 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.06 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.45 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  31.06 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  30.07 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.21 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  31.72 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.64 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  30.2 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  32.37 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
170 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 
174 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  32.88 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  30.77 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  31.97 
 
 
175 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
166 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  35.04 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  32.65 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.45 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  31.13 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>