More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4468 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4468  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.16004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  61.29 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  52.46 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  48.74 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.97 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  47.46 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  39.52 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  45.3 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  42.61 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  44.55 
 
 		 272 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.48 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  40.58 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  45.63 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  40.78 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  36.72 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  38.24 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  35.78 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  37.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  36.81 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  35.77 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  37.72 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  41.24 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  35.77 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  38.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  40 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  42.35 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>