253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1292 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1292  CypC  100 
 
 		 424 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  60.29 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  46.7 
 
 		 415 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  40.38 
 
 		 421 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  44.66 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.52 
 
 		 422 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  45.85 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.72 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.72 
 
 		 440 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  42.65 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46.57 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46.57 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46.57 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  43.56 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  43.39 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  42.47 
 
 		 423 aa  278  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  31.85 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  25.54 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  27.84 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  24.36 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1012  cytochrome P450  25.87 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  22.57 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  23.43 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  22.8 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  26.09 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  26.73 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  24.12 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  25.89 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  30.34 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  27.32 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  27.32 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  28.77 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  25.26 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  29.65 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2276  cytochrome P450-like  37.04 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  26.77 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  27.57 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  27.57 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  22.36 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  27.57 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  23.37 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  30.28 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.8 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  33.12 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  26.95 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  26.32 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.06 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  28.65 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  25.3 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  22.7 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  21.29 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  30.85 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.06 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  33.64 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  33.03 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  25.19 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  30.84 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  25.85 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  22.86 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  22.03 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  29.17 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  29.56 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  27.06 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3733  cytochrome P450 family protein  27.72 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  24.81 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  19.72 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3072  cytochrome P450  30.56 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.863931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  24.61 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  24.57 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  23.12 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  28.57 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1483  cytochrome P450  26.9 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  25.85 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  25.69 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  32.93 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  30.08 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  23.08 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  25.51 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  22.72 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  22.72 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  26.7 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  25.86 
 
 		 1053 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  25.38 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  29.65 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.33 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  24.12 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  28.85 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.32 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  29.02 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  26.82 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  21.8 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  27.22 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  21.55 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  27.01 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  24.05 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  30.82 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  30.77 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.33 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  33.33 
 
 		 450 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  33.33 
 
 		 450 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>