38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2378 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  100 
 
 		 440 aa  888    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  77.95 
 
 		 440 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  98.86 
 
 		 440 aa  880    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  43.1 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  42.2 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  36.84 
 
 		 421 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  41.28 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  41.75 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  43.72 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.13 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.13 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.13 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  41.69 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  39.29 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  38.44 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  39.51 
 
 		 423 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  34.82 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  25.85 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  23.67 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  26.53 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  26.53 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  26.34 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  25.19 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  28.64 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  28.38 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  25.43 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  26.42 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  24.87 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  25.43 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  29.79 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.58 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  27.56 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  23.7 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  27.52 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  28.44 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  28.44 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  27.93 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  28.44 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>