129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3819 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3819  CypC  100 
 
 		 423 aa  833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  37.31 
 
 		 421 aa  319  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  40.99 
 
 		 422 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  43.65 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  42.14 
 
 		 428 aa  299  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  42.47 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  39.55 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  41.48 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  40.39 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  41.64 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  40.39 
 
 		 440 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  39.66 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.49 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.49 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.49 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  35.59 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  26.75 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  26.51 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  21.13 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  28.99 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  26.1 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  26.1 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  24.2 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  37.93 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  24.2 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  24.2 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  33.33 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  23.8 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  23.8 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.01 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  30.36 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  26 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2497  cytochrome P450  42.53 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177201  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.71 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  32.45 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  31.15 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  33.94 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.85 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  21.38 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  31.58 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  29.93 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  27.13 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  29.93 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  21.96 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  21.94 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  21.94 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  21.65 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  28.47 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.56 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  25.61 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.21 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.21 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.21 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  27.21 
 
 		 457 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  27.94 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  36.54 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46438  predicted protein  31.82 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01397  3-hydroxyphenylacetate 6 hydroxylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q078T0]  23.63 
 
 		 517 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0810916  hitchhiker  0.000384612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  26.55 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  20.92 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  20.92 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  25.06 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  23.92 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  23.71 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49761  predicted protein  27.47 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  23.58 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.31 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.57 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.57 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  29.77 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  25.07 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  28.79 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.39 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.08 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  24.93 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  36.27 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  36.27 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  31.65 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  28.79 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  32.39 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.75 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  27 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  24.68 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  36.67 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  23.95 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0387  cytochrome P450  33.62 
 
 		 378 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5948  cytochrome P450  23.94 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.3874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  31.76 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  23.36 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  34.12 
 
 		 468 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  33.1 
 
 		 470 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.9 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.93 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.44 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  29.63 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  25.16 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  23.67 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  21.62 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  33.48 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  25.81 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>