More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0387 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0387  cytochrome P450  100 
 
 
378 aa  742    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00360576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1493  cytochrome P450  71.47 
 
 
364 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0475912  hitchhiker  0.0000580501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2497  cytochrome P450  50.42 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177201  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.92 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.87 
 
 
441 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  30.21 
 
 
429 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  35.42 
 
 
447 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  28.23 
 
 
441 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  25.62 
 
 
454 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  24.44 
 
 
459 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  30.75 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.59 
 
 
447 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  23.1 
 
 
453 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  23.38 
 
 
453 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.62 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  33.78 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  27.33 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  24.82 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.51 
 
 
482 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.25 
 
 
446 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  27.29 
 
 
455 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  37.17 
 
 
450 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  37.17 
 
 
450 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.98 
 
 
1365 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.69 
 
 
448 aa  92.8  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  37.04 
 
 
459 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  29.35 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.34 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  39.47 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.4 
 
 
460 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  35.05 
 
 
445 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  26.28 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  37.04 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  26.46 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  25.48 
 
 
446 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  26.28 
 
 
470 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  28.22 
 
 
462 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  28.21 
 
 
455 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.67 
 
 
452 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  28.01 
 
 
461 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  32.98 
 
 
453 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.61 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  32.75 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  32.16 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  32 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  32.16 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  32.72 
 
 
1380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  32.16 
 
 
453 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  23.94 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  28.07 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  33.51 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  32.72 
 
 
1373 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  22.38 
 
 
493 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.49 
 
 
462 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  25.95 
 
 
462 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  24.03 
 
 
457 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25 
 
 
460 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.05 
 
 
473 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.05 
 
 
473 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  33.33 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  24.81 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  30.65 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  23.79 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  26.9 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.33 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  32.98 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  32.47 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  32.11 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  34.1 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.3 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28 
 
 
471 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  31.09 
 
 
463 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  37.12 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  25.52 
 
 
467 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  34.62 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  31.77 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  28.46 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  31.52 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  29.38 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  22.7 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  22.7 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.31 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  28.72 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  33.96 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  30.41 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30.37 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  31.45 
 
 
466 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  31.16 
 
 
465 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  30.65 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  27.52 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.03 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.45 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  27.02 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  32.08 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>