194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4213 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  82.17 
 
 
428 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  852    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  55.75 
 
 
417 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  46.96 
 
 
421 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  49.14 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  48.76 
 
 
422 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  46.7 
 
 
424 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  44.47 
 
 
417 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  43.69 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.2 
 
 
440 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.2 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  41.5 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  45.45 
 
 
348 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  45.45 
 
 
348 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  45.45 
 
 
348 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  39.05 
 
 
423 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.01 
 
 
470 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  25.5 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  24.03 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  25 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  24.41 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  29.65 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  22.68 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  24.27 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  23.44 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  26.64 
 
 
459 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  25.64 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  23.48 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  23.48 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  23.35 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  27.6 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  24.81 
 
 
460 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  22.68 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  35.71 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  24.38 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  22.38 
 
 
447 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  19.8 
 
 
448 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  22.79 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  21.72 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  22.74 
 
 
448 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  33.56 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  22.35 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  24.41 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  22.54 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  25.54 
 
 
454 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.19 
 
 
461 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  27.27 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  22.82 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  22.49 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  23.91 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  24.61 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  24.23 
 
 
495 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  24.23 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.58 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  25.75 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  25.75 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  22.61 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  21.24 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  25.94 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  21.46 
 
 
551 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  25.94 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  25.94 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  25.21 
 
 
459 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  23.21 
 
 
462 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3072  cytochrome P450  24.72 
 
 
456 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.863931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  21.9 
 
 
460 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  25.13 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  29.1 
 
 
473 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  22.51 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  24.14 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  22.73 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  22.73 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  26.82 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  27.75 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  23.02 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.03 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  25.4 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  24.02 
 
 
1365 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  22.55 
 
 
469 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  25.07 
 
 
395 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  26.7 
 
 
430 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  21.92 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.62 
 
 
448 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  25.15 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  30.22 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  21.45 
 
 
467 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  22.55 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  26.57 
 
 
482 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  22.16 
 
 
441 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  23 
 
 
328 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  27.74 
 
 
474 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  23.38 
 
 
345 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  21.83 
 
 
455 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  20 
 
 
446 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  20.1 
 
 
454 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.12 
 
 
1380 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  27.45 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  27.45 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  23.24 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  28.72 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>