31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1898 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  77.95 
 
 		 440 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  100 
 
 		 440 aa  889    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  78.85 
 
 		 440 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  42.51 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  41.5 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  37.02 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  42.65 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  39.76 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  46 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  38.92 
 
 		 422 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  41.55 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  39.16 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  40.25 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  38.52 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  26.95 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  28.72 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  24.36 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  28.85 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  29.79 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  31.76 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  22.96 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  26.59 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  26.59 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  24.02 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  24.42 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  36.76 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  25.43 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  30 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  29.2 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>