196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4307 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  842    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  60.29 
 
 
424 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  49.14 
 
 
415 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  48.54 
 
 
428 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  49.51 
 
 
417 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  45.57 
 
 
422 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  40.73 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  43.18 
 
 
417 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.23 
 
 
440 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.23 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  40.49 
 
 
440 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  43.66 
 
 
437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  44.22 
 
 
348 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  44.22 
 
 
348 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  44.22 
 
 
348 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  40.74 
 
 
423 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  23.66 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  24.44 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  22.14 
 
 
551 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  23.26 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  21.12 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  28.25 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  32.04 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  22.33 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  27.49 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  22.55 
 
 
455 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  24.3 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.92 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  21.65 
 
 
455 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  19.85 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.53 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  22.42 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  21.62 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  23.01 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  25.71 
 
 
469 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  21.32 
 
 
457 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  23.27 
 
 
479 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  21.19 
 
 
473 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  29.8 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  21.19 
 
 
473 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46438  predicted protein  25.17 
 
 
565 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  35.96 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  23.51 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  23.51 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  21.29 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  23.13 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  23.82 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  19.77 
 
 
453 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.33 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  21.99 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  21.96 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  21.96 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  19.77 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  28.18 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  20.57 
 
 
476 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  28.97 
 
 
493 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  24.88 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  21.96 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  27.78 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  28.85 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  28.85 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  23.9 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  38.24 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  22.64 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  20.34 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  28.29 
 
 
401 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  22.43 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  24.18 
 
 
481 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  19.36 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  26.54 
 
 
345 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  21.93 
 
 
468 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  31.09 
 
 
1365 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  21.95 
 
 
407 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  27.92 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  36.25 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.09 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2497  cytochrome P450  34.82 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177201  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  36.25 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  35.44 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  27.92 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  36.25 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  25.2 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  24.03 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  24.03 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09030  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.85 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3472  putative cytochrome p450 oxidoreductase  30.94 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.19451  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  34.26 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  24.81 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1871  cytochrome P450  29.17 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  29.32 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  25.34 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  21.49 
 
 
480 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  25.34 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5948  cytochrome P450  23.87 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.3874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  22.78 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  24.5 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  26.24 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  24.5 
 
 
457 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  27.21 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>