More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3655 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  100 
 
 
416 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4349  putative cytochrome P450  40.86 
 
 
414 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3367  cytochrome P450-like protein  41.96 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0143  cytochrome P450  40.19 
 
 
407 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1965  cytochrome P450  40.45 
 
 
400 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  28.88 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  29.38 
 
 
405 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  30.62 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  29.03 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  28.96 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  28.53 
 
 
938 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  25.95 
 
 
399 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.7 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  29.94 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  27.41 
 
 
415 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  30.37 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  28.69 
 
 
408 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.45 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  29.15 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2544  cytochrome P450  24.35 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2589  cytochrome P450  24.35 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2582  cytochrome P450  24.35 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416869  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  26.55 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.25 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  27.49 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  29.08 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  27.75 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  25.98 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  27.04 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  27.47 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  25.16 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  25.8 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.8 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  25.8 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.97 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.97 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.97 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  28.31 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.89 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  28.52 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  27.65 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  29.81 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  25.5 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.48 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  24.62 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.8 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  29.72 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  25.72 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  27.22 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  28.57 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  28.83 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  26.07 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  25.9 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  30.58 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  28.05 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  28.81 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  28.81 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  29.47 
 
 
1046 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4180  cytochrome P450  27.63 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0634116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  26.17 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  26.21 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3706  cytochrome P450  26.56 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  26.17 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  26.21 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3779  cytochrome P450  26.56 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793715  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  26.17 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  27.95 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  26.21 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3719  cytochrome P450  26.56 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  28.62 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  29.49 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  28.85 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2474  cytochrome P450  26.89 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  30.13 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  28.43 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  25.41 
 
 
410 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  25.25 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  31.86 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  28.22 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  28.23 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  29.74 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  32.51 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  30.56 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  25.61 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  24.62 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  27.27 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  26.99 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  30.06 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  27.06 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  24.21 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  24.41 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.27 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  25.86 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.18 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  25.55 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4149  cytochrome P450  26 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  30 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  27.93 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  27.93 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  24.33 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>