186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2556 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  100 
 
 
428 aa  881    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  82.17 
 
 
415 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  54.8 
 
 
417 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  46.12 
 
 
421 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  48.54 
 
 
412 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  47.94 
 
 
422 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  44.66 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  44.99 
 
 
417 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.58 
 
 
440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  44.25 
 
 
437 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.1 
 
 
440 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  42.51 
 
 
440 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.73 
 
 
348 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.73 
 
 
348 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  43.73 
 
 
348 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  41.9 
 
 
423 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.05 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  25.5 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  25.75 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  22.33 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  25.52 
 
 
459 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  26.43 
 
 
459 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  29.69 
 
 
462 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.26 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  24.11 
 
 
448 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  24.18 
 
 
460 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  24.66 
 
 
453 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  33.56 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  25.82 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  30.77 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  29.41 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  22.93 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25.54 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.19 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  33.12 
 
 
460 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  28.26 
 
 
461 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  30.6 
 
 
455 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  19.86 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  29.37 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  31.71 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  28.36 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  23.15 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  22.58 
 
 
454 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.19 
 
 
1365 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.94 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3072  cytochrome P450  26.24 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.863931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  22.58 
 
 
454 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  27.97 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  27.97 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  21.17 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22.04 
 
 
459 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  32.57 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  32.57 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  30.46 
 
 
482 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.33 
 
 
450 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46438  predicted protein  27.63 
 
 
565 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  34.82 
 
 
447 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  25.06 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  34.82 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  22.77 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25.75 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  26.18 
 
 
476 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  23 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  21.38 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.75 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  26.87 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  23.91 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  23.94 
 
 
446 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  22.17 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  25.43 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  22.72 
 
 
455 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  23.74 
 
 
450 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  21.6 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.24 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  24 
 
 
469 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  27.69 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  27.69 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  27.69 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  27.5 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  25.46 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  24.88 
 
 
409 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  26.88 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  26.88 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  22.05 
 
 
454 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  22.3 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.35 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  29.94 
 
 
467 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  32.17 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  25.31 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  26.45 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  31.62 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  28.36 
 
 
455 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  30.97 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.22 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  20.8 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  30 
 
 
490 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.97 
 
 
445 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  22.03 
 
 
428 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3226  cytochrome P450  26.6 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2579  cytochrome P450  26.6 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>