72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3514 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  100 
 
 
417 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  49.51 
 
 
412 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  44.99 
 
 
428 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  44.47 
 
 
415 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  45.85 
 
 
424 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.14 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.14 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.14 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  42.16 
 
 
422 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  37.59 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  41.55 
 
 
440 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  41.94 
 
 
440 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  41.69 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  40.64 
 
 
417 aa  282  8.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  40.92 
 
 
437 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  35.59 
 
 
423 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  28.32 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  32.35 
 
 
457 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  32.35 
 
 
457 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  33.33 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  28.12 
 
 
454 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  29.81 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  28.12 
 
 
454 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  29.91 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  29.33 
 
 
490 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  23.65 
 
 
476 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  29.81 
 
 
450 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  29.81 
 
 
450 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.33 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  35 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  32.97 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  21.53 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  31.87 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  37.97 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  33.33 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  32.26 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.14 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  28.26 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  29.46 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  32.73 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  26.81 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  32.26 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.63 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  31.65 
 
 
452 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30.21 
 
 
448 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0387  cytochrome P450  36.36 
 
 
378 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00360576  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  26.81 
 
 
471 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.19 
 
 
551 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  28.35 
 
 
447 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  28.35 
 
 
447 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  29.51 
 
 
452 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.35 
 
 
445 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  28.35 
 
 
447 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  26.43 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  31.18 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  26.52 
 
 
455 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25.77 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  28.18 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  31.48 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.77 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  26.45 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  29.17 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  27.56 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0929  cytochrome P450  26.51 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  31.75 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  25.21 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  28.15 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  28.5 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  26.32 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  24.44 
 
 
453 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1493  cytochrome P450  35.79 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0475912  hitchhiker  0.0000580501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  29.36 
 
 
445 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>