35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1038 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2378  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  98.86 
 
 		 440 aa  880    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.615227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1898  cytochrome P450-like protein  78.85 
 
 		 440 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552703  normal  0.795827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1038  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  100 
 
 		 440 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.585241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2556  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  43.58 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4213  fatty acid alpha hydroxylase, cytochrome P450  42.2 
 
 		 415 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2911  cytochrome P450  36.6 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1442  fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  41.28 
 
 		 422 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4307  cytochrome P450  41.75 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1292  CypC  43.72 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4474  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.42 
 
 		 348 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4305  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.42 
 
 		 348 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.937913  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4205  putative fatty acid beta hydroxylase (cytochrome P450)  49.42 
 
 		 348 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.73506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3514  fatty acid alpha hydroxylase  41.94 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25820  cytochrome P450  39.05 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5322  fatty acid alpha hydroxylase cytochrome P450  38.44 
 
 		 437 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3819  CypC  39.51 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  34.82 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  25.85 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  23.67 
 
 		 459 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  26.53 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  26.53 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  26.34 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  25.19 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  28.38 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  28.64 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  26.42 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  25.13 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  25.43 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  29.79 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  25.43 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.58 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  26.52 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  24.24 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  24.86 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.82 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>