43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2083 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  60.69 
 
 		 952 aa  974    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  100 
 
 		 885 aa  1752    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  34.81 
 
 		 863 aa  419  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1010 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  31.45 
 
 		 807 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  27.2 
 
 		 834 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  35.69 
 
 		 942 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  25.2 
 
 		 859 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  23.84 
 
 		 825 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  29.24 
 
 		 800 aa  210  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  30.26 
 
 		 845 aa  210  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  28.94 
 
 		 843 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  25.7 
 
 		 853 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.13 
 
 		 865 aa  194  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  25.46 
 
 		 812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  27.61 
 
 		 799 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  26.14 
 
 		 859 aa  184  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  29.59 
 
 		 800 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  27.26 
 
 		 815 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  29.68 
 
 		 802 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  29.2 
 
 		 801 aa  178  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  29.3 
 
 		 802 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  29.31 
 
 		 801 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  29.59 
 
 		 802 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  28.62 
 
 		 800 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  27.58 
 
 		 794 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  28.99 
 
 		 801 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  26.76 
 
 		 862 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  29.51 
 
 		 800 aa  170  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  29.38 
 
 		 800 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  23.83 
 
 		 837 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  23.99 
 
 		 812 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  23.48 
 
 		 846 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  28.7 
 
 		 837 aa  167  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  29.03 
 
 		 798 aa  165  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  29.38 
 
 		 800 aa  166  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  23.53 
 
 		 827 aa  160  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  22.57 
 
 		 890 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  30 
 
 		 737 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  24.87 
 
 		 846 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  27.91 
 
 		 850 aa  131  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3954  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1152 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0404  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1152 aa  45.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>