41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4490 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  100 
 
 
843 aa  1738    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  47.7 
 
 
845 aa  717    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  48.61 
 
 
815 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  46.29 
 
 
800 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  43.66 
 
 
802 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  43.37 
 
 
802 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  43.3 
 
 
801 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  43.08 
 
 
802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  41.87 
 
 
794 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  42.32 
 
 
800 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  41.55 
 
 
799 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  40.18 
 
 
837 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  40.68 
 
 
801 aa  549  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  41.99 
 
 
800 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  41.99 
 
 
800 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  41.84 
 
 
800 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  41.11 
 
 
801 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  44.63 
 
 
737 aa  539  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  40.57 
 
 
800 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  41.46 
 
 
798 aa  525  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  36.91 
 
 
807 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  31.41 
 
 
850 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  28.85 
 
 
885 aa  204  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  28.55 
 
 
863 aa  195  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  31.34 
 
 
825 aa  194  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  30.71 
 
 
942 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  28.22 
 
 
859 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  29.41 
 
 
812 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  28.42 
 
 
952 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  28.52 
 
 
827 aa  164  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  30.45 
 
 
1010 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  26.86 
 
 
865 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  28.47 
 
 
853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  24.31 
 
 
812 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  30.56 
 
 
890 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  25.87 
 
 
846 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  25.07 
 
 
834 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  25.31 
 
 
846 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  27.3 
 
 
837 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  27.96 
 
 
859 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  28.73 
 
 
862 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>