41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2967 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 952 aa  1894    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  60.54 
 
 		 885 aa  982    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1010 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  33.03 
 
 		 863 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  30.18 
 
 		 942 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  25.9 
 
 		 825 aa  218  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  28.05 
 
 		 807 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  25.85 
 
 		 834 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.81 
 
 		 859 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.89 
 
 		 853 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  29.28 
 
 		 843 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.65 
 
 		 865 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  27.55 
 
 		 845 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  24.65 
 
 		 812 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  24.6 
 
 		 890 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  27.3 
 
 		 815 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  26.01 
 
 		 837 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  30.17 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  25.42 
 
 		 800 aa  153  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  24.52 
 
 		 812 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  25.48 
 
 		 846 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  24.9 
 
 		 801 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  26.75 
 
 		 794 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  25.27 
 
 		 827 aa  137  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  26.57 
 
 		 802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  26.75 
 
 		 802 aa  135  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  26.38 
 
 		 802 aa  134  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  24.01 
 
 		 801 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  24.48 
 
 		 800 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  25.71 
 
 		 800 aa  128  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  23.89 
 
 		 846 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  24.09 
 
 		 800 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  24.22 
 
 		 800 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  26.58 
 
 		 859 aa  119  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  26.82 
 
 		 801 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  27.35 
 
 		 737 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  25.04 
 
 		 798 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  27.16 
 
 		 800 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  26.39 
 
 		 799 aa  111  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  25.8 
 
 		 837 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  23.99 
 
 		 850 aa  87  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>