41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0628 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  65.54 
 
 		 800 aa  1084    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  67.18 
 
 		 802 aa  1094    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  81.9 
 
 		 801 aa  1369    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  66.79 
 
 		 802 aa  1092    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  76.53 
 
 		 801 aa  1283    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  67.31 
 
 		 802 aa  1098    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  65.04 
 
 		 800 aa  1093    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  72.66 
 
 		 799 aa  1196    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  66.76 
 
 		 737 aa  1032    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  66.17 
 
 		 794 aa  1080    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  65.29 
 
 		 798 aa  1054    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  65.29 
 
 		 800 aa  1073    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  65.54 
 
 		 800 aa  1080    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  65.42 
 
 		 800 aa  1076    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  42.86 
 
 		 800 aa  625  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  42.15 
 
 		 845 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  41.36 
 
 		 815 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  41.11 
 
 		 843 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  37.88 
 
 		 837 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  37.03 
 
 		 850 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  31.59 
 
 		 807 aa  364  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  28.94 
 
 		 885 aa  178  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  28.61 
 
 		 942 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  30.32 
 
 		 825 aa  140  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  25.65 
 
 		 863 aa  133  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  24.48 
 
 		 952 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  26.61 
 
 		 827 aa  124  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  23.3 
 
 		 865 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1010 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.85 
 
 		 859 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  24.53 
 
 		 812 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  25.72 
 
 		 890 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  29.87 
 
 		 812 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  28.76 
 
 		 837 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  24.09 
 
 		 862 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.43 
 
 		 853 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  23.51 
 
 		 834 aa  103  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  28.23 
 
 		 846 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  24.21 
 
 		 859 aa  97.4  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  24.71 
 
 		 846 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>