41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3925 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  48.91 
 
 		 812 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  42.14 
 
 		 846 aa  672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  40.76 
 
 		 846 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  49.77 
 
 		 853 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  47.03 
 
 		 890 aa  740    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  100 
 
 		 859 aa  1778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  43.96 
 
 		 837 aa  661    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  47.24 
 
 		 812 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  44.47 
 
 		 827 aa  679    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  47.43 
 
 		 834 aa  725    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  38.4 
 
 		 825 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  38.08 
 
 		 865 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  36.35 
 
 		 862 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  33.11 
 
 		 859 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  25.2 
 
 		 885 aa  217  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1010 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  24 
 
 		 952 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  26.14 
 
 		 845 aa  170  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  28.22 
 
 		 843 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  22.86 
 
 		 863 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  28.48 
 
 		 807 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  25.52 
 
 		 800 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  25.84 
 
 		 815 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  23.55 
 
 		 794 aa  128  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  26.38 
 
 		 942 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  25.58 
 
 		 837 aa  124  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  26.18 
 
 		 800 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  27.92 
 
 		 799 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  25.75 
 
 		 800 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  25.54 
 
 		 800 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  26.93 
 
 		 798 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  27.16 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  27.44 
 
 		 801 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  26.67 
 
 		 801 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  23.61 
 
 		 802 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  24.4 
 
 		 801 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  27.12 
 
 		 802 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  26.8 
 
 		 802 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  26.8 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  24.72 
 
 		 800 aa  105  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  24.58 
 
 		 850 aa  89.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>