41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2029 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1797    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  38.75 
 
 		 834 aa  501  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  33.84 
 
 		 862 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  37.18 
 
 		 825 aa  452  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  38.5 
 
 		 865 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  34.62 
 
 		 846 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  32.68 
 
 		 890 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  33.11 
 
 		 853 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  33.17 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  33.58 
 
 		 859 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  33.47 
 
 		 846 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  35.76 
 
 		 812 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  32.85 
 
 		 827 aa  344  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  34.7 
 
 		 837 aa  341  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  26.25 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  26.49 
 
 		 885 aa  180  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  27.82 
 
 		 807 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1010 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.29 
 
 		 942 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  27.96 
 
 		 843 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  28.6 
 
 		 845 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  26.53 
 
 		 815 aa  119  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.44 
 
 		 952 aa  117  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  23.19 
 
 		 800 aa  111  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  28.01 
 
 		 837 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  27.44 
 
 		 800 aa  104  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  27.27 
 
 		 799 aa  102  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  27.41 
 
 		 801 aa  99.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  26.26 
 
 		 802 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  25.92 
 
 		 802 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  27 
 
 		 800 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  23.41 
 
 		 794 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  25.41 
 
 		 800 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  25.76 
 
 		 800 aa  96.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  26.82 
 
 		 802 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  24.59 
 
 		 801 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  27 
 
 		 800 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  25.98 
 
 		 737 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  24.21 
 
 		 801 aa  91.3  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  28.61 
 
 		 850 aa  87.4  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  27.94 
 
 		 798 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>