41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11328 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1706    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  52.28 
 
 
834 aa  810    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  40.61 
 
 
853 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  38.29 
 
 
859 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  38.14 
 
 
890 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  37.17 
 
 
812 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  36.69 
 
 
846 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  37.85 
 
 
837 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  36.1 
 
 
846 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  36.97 
 
 
812 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  35.2 
 
 
827 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  39.04 
 
 
862 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  38.56 
 
 
865 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  37.18 
 
 
859 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  25.22 
 
 
863 aa  225  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  24.26 
 
 
885 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  25.2 
 
 
952 aa  211  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  31.34 
 
 
843 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  26.92 
 
 
845 aa  179  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  30.53 
 
 
815 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  29.39 
 
 
800 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  26.2 
 
 
807 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  32.2 
 
 
794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  30.33 
 
 
801 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  29.51 
 
 
800 aa  146  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  29.92 
 
 
800 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  29.95 
 
 
798 aa  144  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  28.61 
 
 
837 aa  144  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  29.65 
 
 
800 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  30.37 
 
 
800 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  30.21 
 
 
801 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  29.78 
 
 
802 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  30.05 
 
 
737 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  29.78 
 
 
802 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  29.3 
 
 
799 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  30.05 
 
 
802 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  29.2 
 
 
800 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  29.73 
 
 
801 aa  137  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  27.34 
 
 
1010 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  26.45 
 
 
942 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  24.04 
 
 
850 aa  87.8  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>