41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0296 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  100 
 
 
837 aa  1670    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  43.81 
 
 
845 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  40.18 
 
 
843 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  37.04 
 
 
800 aa  515  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  38.62 
 
 
801 aa  505  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  38.87 
 
 
801 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  39.05 
 
 
794 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  38.51 
 
 
815 aa  499  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  39.17 
 
 
799 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  37.88 
 
 
801 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  36.63 
 
 
800 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  36.49 
 
 
800 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  36.5 
 
 
800 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  36.5 
 
 
800 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  37.12 
 
 
798 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  35.45 
 
 
802 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  34.02 
 
 
800 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  35.2 
 
 
802 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  35.11 
 
 
802 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  36.33 
 
 
737 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  34.43 
 
 
807 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  33.33 
 
 
850 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  27.83 
 
 
885 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  29.11 
 
 
1010 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.55 
 
 
942 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  26.65 
 
 
863 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  28.61 
 
 
825 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  25.78 
 
 
952 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  25.66 
 
 
859 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.79 
 
 
865 aa  127  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  30 
 
 
812 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  27.31 
 
 
827 aa  121  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  28.85 
 
 
837 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  23.4 
 
 
834 aa  111  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  28.21 
 
 
862 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  27.88 
 
 
812 aa  109  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  28.14 
 
 
890 aa  107  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  28.01 
 
 
859 aa  105  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  24 
 
 
846 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  25.65 
 
 
846 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  26.87 
 
 
853 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>