42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3299 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  81 
 
 		 800 aa  1341    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  86.15 
 
 		 802 aa  1399    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  64.92 
 
 		 801 aa  1077    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  86.28 
 
 		 802 aa  1402    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  64.04 
 
 		 801 aa  1058    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  65.04 
 
 		 801 aa  1077    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  86.02 
 
 		 802 aa  1402    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  65.38 
 
 		 799 aa  1061    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  86.16 
 
 		 737 aa  1309    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  63 
 
 		 794 aa  1018    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  65.67 
 
 		 798 aa  1047    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  81.25 
 
 		 800 aa  1330    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  80.88 
 
 		 800 aa  1326    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  80.75 
 
 		 800 aa  1322    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  43.84 
 
 		 800 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  40.4 
 
 		 815 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  40.66 
 
 		 845 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  40.57 
 
 		 843 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  34.02 
 
 		 837 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  36.71 
 
 		 850 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  31.13 
 
 		 807 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  29.86 
 
 		 885 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.11 
 
 		 942 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  25.47 
 
 		 863 aa  157  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  30.37 
 
 		 825 aa  142  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1010 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  25.68 
 
 		 827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  26.15 
 
 		 812 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.67 
 
 		 952 aa  111  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  25.89 
 
 		 862 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  23.13 
 
 		 865 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.72 
 
 		 859 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  27.44 
 
 		 859 aa  104  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.8 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  24.69 
 
 		 834 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  29.17 
 
 		 812 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  25 
 
 		 890 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  23.46 
 
 		 846 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  28.23 
 
 		 846 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  26.85 
 
 		 837 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3954  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1152 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>