41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05500 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  51.47 
 
 		 825 aa  819    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  44.88 
 
 		 853 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  43.21 
 
 		 890 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  47.43 
 
 		 859 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1727    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  42.53 
 
 		 837 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  39.69 
 
 		 846 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  45.53 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  44.7 
 
 		 812 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  41.51 
 
 		 846 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  42.2 
 
 		 862 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  39.42 
 
 		 827 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  38.69 
 
 		 865 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  37.9 
 
 		 859 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  27.21 
 
 		 885 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  25.56 
 
 		 952 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  23.9 
 
 		 863 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  26.09 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  25.17 
 
 		 843 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  26.56 
 
 		 845 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  27.36 
 
 		 942 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  24.88 
 
 		 800 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1010 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  26.9 
 
 		 815 aa  114  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  24.3 
 
 		 794 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  27.15 
 
 		 837 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  22.82 
 
 		 800 aa  102  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  22.96 
 
 		 800 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  24.69 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  25.74 
 
 		 801 aa  99.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  23.51 
 
 		 801 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  22.92 
 
 		 800 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  23.94 
 
 		 799 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  25.98 
 
 		 801 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  23.14 
 
 		 800 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  23.88 
 
 		 802 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  25.92 
 
 		 798 aa  93.2  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  23.47 
 
 		 802 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  23.27 
 
 		 802 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  23.61 
 
 		 737 aa  87.4  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  23.74 
 
 		 850 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>