42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0557 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  52.33 
 
 		 812 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  44.47 
 
 		 859 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1719    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  50.72 
 
 		 812 aa  839    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  43.28 
 
 		 890 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  40.49 
 
 		 846 aa  618  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  40.52 
 
 		 853 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  43.79 
 
 		 837 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  40.83 
 
 		 846 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  39.65 
 
 		 834 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  34.81 
 
 		 825 aa  485  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  39.45 
 
 		 865 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  37.98 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  31.28 
 
 		 859 aa  346  8.999999999999999e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  28.52 
 
 		 843 aa  164  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1010 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  23.67 
 
 		 885 aa  160  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  23.21 
 
 		 863 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  25.1 
 
 		 845 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  27.4 
 
 		 815 aa  144  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  29.17 
 
 		 800 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  26.37 
 
 		 807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  25.79 
 
 		 794 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  27.06 
 
 		 801 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  25.76 
 
 		 942 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  26.71 
 
 		 801 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  27.31 
 
 		 837 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  25.43 
 
 		 802 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  25.39 
 
 		 802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  25.83 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  27.37 
 
 		 798 aa  119  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  25.73 
 
 		 801 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  25.82 
 
 		 800 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  25.24 
 
 		 802 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  25.84 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  24.76 
 
 		 800 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  24.95 
 
 		 800 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  25.9 
 
 		 800 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  24.78 
 
 		 737 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  25.71 
 
 		 952 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  26.12 
 
 		 850 aa  79.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000788  MoxR-like ATPase  25.83 
 
 		 1372 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>