42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01042 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  48.61 
 
 
843 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  43.91 
 
 
845 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  100 
 
 
815 aa  1684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  57.14 
 
 
800 aa  914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  43.05 
 
 
801 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  40.92 
 
 
794 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  41.83 
 
 
800 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  42.32 
 
 
799 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  41.39 
 
 
801 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  43.21 
 
 
802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  40.4 
 
 
800 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  43.84 
 
 
802 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  42.8 
 
 
802 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  41.36 
 
 
801 aa  598  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  40.7 
 
 
800 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  40.7 
 
 
800 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  40.43 
 
 
800 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  44.61 
 
 
737 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  40.34 
 
 
798 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  38.51 
 
 
837 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  36.87 
 
 
850 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  33.89 
 
 
807 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  29.49 
 
 
863 aa  197  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  27.36 
 
 
885 aa  178  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  30.53 
 
 
825 aa  175  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  29.38 
 
 
1010 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  26.58 
 
 
942 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  27.61 
 
 
827 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.61 
 
 
952 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  25.75 
 
 
846 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  27.4 
 
 
812 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.51 
 
 
859 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  27.3 
 
 
890 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  27.8 
 
 
865 aa  124  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  25.78 
 
 
862 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  27.43 
 
 
837 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  26.53 
 
 
859 aa  119  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  28.2 
 
 
812 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  26.9 
 
 
834 aa  114  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  24.42 
 
 
846 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.06 
 
 
853 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000788  MoxR-like ATPase  51.02 
 
 
1372 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>