41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4438 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  100 
 
 
807 aa  1650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  36.91 
 
 
843 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  36.95 
 
 
845 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  32 
 
 
800 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  32.66 
 
 
801 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  32.46 
 
 
799 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  33.03 
 
 
802 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  32.9 
 
 
802 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  32.36 
 
 
802 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  33.72 
 
 
794 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  32.76 
 
 
800 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  34.59 
 
 
815 aa  365  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  34.43 
 
 
837 aa  364  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  32.76 
 
 
800 aa  364  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  33.38 
 
 
800 aa  360  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  31.22 
 
 
801 aa  360  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  32.88 
 
 
800 aa  355  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  33.38 
 
 
801 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  31.13 
 
 
800 aa  349  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  32.51 
 
 
737 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  32.74 
 
 
798 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  31.41 
 
 
850 aa  293  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  31.54 
 
 
885 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  29.29 
 
 
863 aa  211  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  28.01 
 
 
952 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  32.37 
 
 
942 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  31.78 
 
 
1010 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  27.15 
 
 
825 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  27.82 
 
 
859 aa  158  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  26.18 
 
 
834 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  28.13 
 
 
862 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  28.48 
 
 
859 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  26.6 
 
 
812 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  27.27 
 
 
846 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  28.16 
 
 
853 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  26.37 
 
 
827 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  25.5 
 
 
890 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.43 
 
 
865 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  31.63 
 
 
837 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  24.47 
 
 
812 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  24.61 
 
 
846 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>