41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0271 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  47.7 
 
 		 843 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  43.47 
 
 		 815 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  42.66 
 
 		 800 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  43.81 
 
 		 837 aa  606  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  43 
 
 		 801 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  42.15 
 
 		 801 aa  595  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  42.44 
 
 		 799 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  42.23 
 
 		 801 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  46.73 
 
 		 794 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  42.45 
 
 		 800 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  41.7 
 
 		 800 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  41.82 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  41.57 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  41.35 
 
 		 802 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  41.22 
 
 		 802 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  41.35 
 
 		 802 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  40.69 
 
 		 800 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  40.36 
 
 		 798 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  41.45 
 
 		 737 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  38.36 
 
 		 850 aa  429  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  36.68 
 
 		 807 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  30.29 
 
 		 885 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  29.62 
 
 		 863 aa  188  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  26.92 
 
 		 825 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  26.14 
 
 		 859 aa  171  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  25.63 
 
 		 865 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  31 
 
 		 1010 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.95 
 
 		 942 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.75 
 
 		 952 aa  154  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  26.23 
 
 		 812 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  25 
 
 		 812 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  25.1 
 
 		 827 aa  144  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  28.66 
 
 		 853 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  25.69 
 
 		 846 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  27.77 
 
 		 837 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  26.56 
 
 		 834 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  28.6 
 
 		 859 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  26.75 
 
 		 862 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  29.13 
 
 		 890 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  26.5 
 
 		 846 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>