42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0538 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  84.26 
 
 
800 aa  1285    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  86.16 
 
 
800 aa  1309    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  67.44 
 
 
799 aa  1025    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  100 
 
 
737 aa  1497    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  97.96 
 
 
802 aa  1472    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  63.91 
 
 
794 aa  961    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  84.12 
 
 
800 aa  1291    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  97.83 
 
 
802 aa  1468    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  67.03 
 
 
798 aa  984    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  84.4 
 
 
800 aa  1288    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  66.76 
 
 
801 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  66.49 
 
 
801 aa  1027    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  98.64 
 
 
802 aa  1480    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  84.4 
 
 
800 aa  1293    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  67.03 
 
 
801 aa  1034    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  44.61 
 
 
800 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  44.61 
 
 
815 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  44.63 
 
 
843 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  41.45 
 
 
845 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  36.33 
 
 
837 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  37.07 
 
 
850 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  32.51 
 
 
807 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  30.23 
 
 
885 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.61 
 
 
942 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  30.05 
 
 
825 aa  140  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  27.3 
 
 
863 aa  138  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  25 
 
 
1010 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  26.71 
 
 
862 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.35 
 
 
952 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  24.78 
 
 
827 aa  112  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  26.8 
 
 
859 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.29 
 
 
865 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  24.22 
 
 
846 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  25.57 
 
 
812 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  25.98 
 
 
859 aa  94.4  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  29.11 
 
 
812 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.66 
 
 
853 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  26.48 
 
 
890 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  23.61 
 
 
834 aa  87.4  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  27.33 
 
 
846 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  26.07 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0404  hypothetical protein  30.09 
 
 
1152 aa  45.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>