41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4495 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  46.46 
 
 		 812 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  47.2 
 
 		 837 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  46.32 
 
 		 846 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  100 
 
 		 846 aa  1764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  47.77 
 
 		 853 aa  802    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  47.29 
 
 		 890 aa  732    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  41.75 
 
 		 859 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  44.22 
 
 		 812 aa  619  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  42.54 
 
 		 834 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  41.83 
 
 		 827 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  36.58 
 
 		 825 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  37.88 
 
 		 865 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  35.11 
 
 		 862 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 859 aa  402  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  25.55 
 
 		 885 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  23.58 
 
 		 863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  24.93 
 
 		 952 aa  141  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1010 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  25.31 
 
 		 843 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  25.69 
 
 		 845 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  27.39 
 
 		 800 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  25.75 
 
 		 815 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  25.53 
 
 		 942 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  24 
 
 		 837 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  23.26 
 
 		 800 aa  103  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  24.59 
 
 		 794 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  23.09 
 
 		 800 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  23.07 
 
 		 800 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  27.04 
 
 		 798 aa  101  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  23.16 
 
 		 802 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  24.22 
 
 		 737 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  24.34 
 
 		 802 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  23.64 
 
 		 802 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  24.67 
 
 		 800 aa  98.2  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  27.5 
 
 		 801 aa  97.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  25.72 
 
 		 801 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  23.46 
 
 		 800 aa  95.5  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  27.71 
 
 		 799 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  24.18 
 
 		 801 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  25.05 
 
 		 850 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>