42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1102 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  44.29 
 
 		 800 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  46.29 
 
 		 843 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  43.91 
 
 		 802 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  57.14 
 
 		 815 aa  896    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  42.8 
 
 		 801 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  43.96 
 
 		 802 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  44.44 
 
 		 801 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  43.84 
 
 		 802 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  43.84 
 
 		 800 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  44.68 
 
 		 799 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  44.58 
 
 		 798 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  43.9 
 
 		 800 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  43.77 
 
 		 800 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  43.9 
 
 		 800 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  43.12 
 
 		 794 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  42.84 
 
 		 845 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 801 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  44.61 
 
 		 737 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  37.04 
 
 		 837 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  34.6 
 
 		 850 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  32 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  29.24 
 
 		 885 aa  210  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  28.15 
 
 		 863 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  29.39 
 
 		 825 aa  165  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  28.22 
 
 		 942 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.12 
 
 		 952 aa  152  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1010 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  29.17 
 
 		 827 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.55 
 
 		 859 aa  131  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  26.51 
 
 		 812 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  27.6 
 
 		 837 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  24.88 
 
 		 862 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  29.26 
 
 		 890 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  27.39 
 
 		 846 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  25.48 
 
 		 846 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  26.67 
 
 		 865 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  24.88 
 
 		 834 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  26.75 
 
 		 812 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  23.19 
 
 		 859 aa  111  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.28 
 
 		 853 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000788  MoxR-like ATPase  38.78 
 
 		 1372 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>