41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  100 
 
 		 850 aa  1651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  34.55 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  37.89 
 
 		 801 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  37.45 
 
 		 800 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  36.72 
 
 		 845 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  36.98 
 
 		 815 aa  432  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  35.69 
 
 		 801 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  37.39 
 
 		 800 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  37.95 
 
 		 794 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  33.84 
 
 		 800 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  37.54 
 
 		 800 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  37.18 
 
 		 801 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  37.25 
 
 		 800 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  37.41 
 
 		 802 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  36.71 
 
 		 802 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  37.05 
 
 		 799 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  36.82 
 
 		 802 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  37.07 
 
 		 737 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  31.65 
 
 		 843 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  37.76 
 
 		 798 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 837 aa  340  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  31.47 
 
 		 807 aa  301  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  28.12 
 
 		 885 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  24.25 
 
 		 863 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  26.33 
 
 		 942 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  24.68 
 
 		 825 aa  90.1  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  24.26 
 
 		 859 aa  88.6  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  24.38 
 
 		 859 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1010 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  30.89 
 
 		 846 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  26.12 
 
 		 827 aa  79  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  23.66 
 
 		 952 aa  78.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  24.24 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  23.8 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  26.14 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  29.11 
 
 		 862 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  28.27 
 
 		 812 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  22.77 
 
 		 834 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  24.8 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  26.87 
 
 		 890 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  26.96 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>