148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4318 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4318  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
658 aa  1318    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2866  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
1009 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.715807  hitchhiker  0.00303545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3255  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
1009 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
435 aa  64.3  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 
420 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
517 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
429 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
392 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
357 aa  57.4  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
373 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
363 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
352 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
376 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
387 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
377 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  28.67 
 
 
347 aa  54.7  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.74 
 
 
355 aa  53.9  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
386 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
377 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
352 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
389 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
367 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
384 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
379 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
384 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
374 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
402 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  26.7 
 
 
392 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
391 aa  51.6  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
738 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  27.31 
 
 
376 aa  51.2  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  24.31 
 
 
429 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
355 aa  50.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
660 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
819 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
388 aa  50.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
379 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  32.02 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
739 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  29.38 
 
 
553 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
810 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  27.45 
 
 
347 aa  50.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
411 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 
407 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
353 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  27.63 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
438 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 
352 aa  49.7  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
425 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
362 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
349 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
434 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 
438 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2524  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
392 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0258143  normal  0.31108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
871 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.74 
 
 
354 aa  47.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.74 
 
 
354 aa  47.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
340 aa  47.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
406 aa  47.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
390 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
397 aa  47.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
396 aa  47.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  23.63 
 
 
414 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
394 aa  47.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
390 aa  47.4  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
384 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
373 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
343 aa  47.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
639 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
816 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
384 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
385 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
376 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08710  glycosyltransferase  30.77 
 
 
374 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  27.89 
 
 
389 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  31.15 
 
 
816 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
367 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.27 
 
 
367 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  20.91 
 
 
343 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
388 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
387 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
518 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
768 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  30.16 
 
 
379 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
374 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
330 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  28.68 
 
 
344 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>