More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4156 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.656467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3797  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
272 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
254 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239366  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
254 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.65 
 
 
254 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0898136  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.32 
 
 
258 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.05359  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0275  putative short chain dehydrogenase  53.1 
 
 
257 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.599056  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7117  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
255 aa  231  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0997  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
257 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.55 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
258 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
257 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554657  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
255 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 
256 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0841499  normal  0.0258312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
255 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
254 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0822  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  44.79 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  48.79 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
252 aa  211  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
259 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.33 
 
 
255 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
259 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
254 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
252 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
251 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.718572  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
254 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0877268  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
254 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
258 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.159909  hitchhiker  0.00000102018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
252 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
252 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
250 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.51 
 
 
259 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
252 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
252 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
252 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
273 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
252 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
255 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
261 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
254 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.153501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
252 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
252 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
259 aa  201  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
253 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1700  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  46.85 
 
 
251 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  0.0357096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
255 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518029  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
250 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
250 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
250 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.153171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11167  short-chain type dehydrogenase/reductase  46.09 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7091  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  45.82 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  47.98 
 
 
252 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
260 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118579  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07360  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
254 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
261 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
255 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1279  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
255 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
253 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
261 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00690  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.45 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
252 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
254 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162049  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
260 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
257 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
254 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
252 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
253 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2720  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  41.94 
 
 
255 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
252 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
255 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
260 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
260 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
262 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
251 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  48.79 
 
 
252 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  45.16 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
267 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
254 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0244002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>