More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0123 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.37 
 
 
255 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.69 
 
 
259 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.37 
 
 
255 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554657  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.02 
 
 
255 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7117  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.95 
 
 
255 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1279  short chain dehydrogenase  60.16 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.22 
 
 
254 aa  298  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
250 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
250 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.86 
 
 
254 aa  272  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0877268  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
254 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.153501  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
259 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
254 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11167  short-chain type dehydrogenase/reductase  54.51 
 
 
250 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
253 aa  258  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530107  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
252 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
259 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
252 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
253 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7121  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  58.7 
 
 
252 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
252 aa  250  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
252 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.47 
 
 
255 aa  248  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
252 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 
255 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
252 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
252 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21880  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.54 
 
 
273 aa  246  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281011  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
256 aa  244  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
255 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.94 
 
 
255 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
256 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
252 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
254 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
254 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.37 
 
 
254 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
257 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.68 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.37 
 
 
258 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  51.82 
 
 
252 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0275  putative short chain dehydrogenase  52.34 
 
 
257 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.599056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0923  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.06 
 
 
319 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.732955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2515  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  55.06 
 
 
252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0926  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.06 
 
 
319 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0380  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  55.06 
 
 
252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1079  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  55.06 
 
 
252 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.06 
 
 
252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.06 
 
 
252 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
255 aa  234  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.159909  hitchhiker  0.00000102018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  54.66 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
259 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.55 
 
 
261 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4382  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.37 
 
 
255 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0363369  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
252 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.34 
 
 
263 aa  232  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1684  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
252 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
252 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
252 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.76 
 
 
261 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
252 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
255 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 
255 aa  228  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
279 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
255 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.04 
 
 
252 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 
251 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
252 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
252 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
255 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.215235  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
252 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31510  putative short-chain dehydrogenase  51.21 
 
 
255 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.089471  hitchhiker  0.000038143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2682  putative short-chain dehydrogenase  51.21 
 
 
255 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
255 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
252 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 
252 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  49.8 
 
 
252 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
253 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0244002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00690  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.57 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3797  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
272 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
254 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239366  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.91 
 
 
261 aa  224  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
254 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 
260 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
252 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6651  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
255 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170863  normal  0.0297726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
255 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0822  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  44.02 
 
 
259 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>