More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0516 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0841499  normal  0.0258312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0997  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  78.76 
 
 
257 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.9 
 
 
257 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0275  putative short chain dehydrogenase  68.73 
 
 
257 aa  354  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.599056  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.86 
 
 
257 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
259 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
273 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.29 
 
 
256 aa  274  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.05 
 
 
252 aa  263  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
252 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
252 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.89 
 
 
259 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
254 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
250 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
252 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  52.12 
 
 
252 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 
252 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.1 
 
 
260 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00690  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.05 
 
 
252 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 
254 aa  248  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
252 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
252 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
251 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.718572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 
253 aa  245  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
252 aa  244  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  244  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  49.42 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
252 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
255 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
254 aa  241  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3797  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
272 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239366  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
255 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0816341  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
259 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
252 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  50.19 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
252 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
252 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
255 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1279  short chain dehydrogenase  48.65 
 
 
252 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
259 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
256 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.35 
 
 
252 aa  235  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7091  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  51.92 
 
 
254 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.04 
 
 
255 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11167  short-chain type dehydrogenase/reductase  49.62 
 
 
250 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
255 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0912  3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase  48.44 
 
 
254 aa  234  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.44 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.767039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2720  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  48.28 
 
 
255 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.74 
 
 
253 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.580386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
254 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
252 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
255 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
253 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
255 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
250 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
254 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162049  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
261 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.51 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
254 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 
255 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1700  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  46.88 
 
 
251 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  0.0357096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
250 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
255 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
255 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.153171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
259 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.656467  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 
260 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
261 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
251 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.51 
 
 
254 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.153501  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
255 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07360  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
254 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.66 
 
 
250 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.66 
 
 
250 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.66 
 
 
250 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.84 
 
 
255 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5880  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
252 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175466  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.74 
 
 
252 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4382  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.84 
 
 
255 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0363369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
252 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0926  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.35 
 
 
319 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
252 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0380  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.35 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1079  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.35 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.35 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2515  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.35 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.35 
 
 
252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
254 aa  224  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
255 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
260 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>