More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0024 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.46 
 
 
260 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.15 
 
 
260 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118579  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.07 
 
 
261 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.22 
 
 
261 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5433  Short-chain alcohol dehydrogenase/3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase  61.87 
 
 
260 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.23 
 
 
260 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.85 
 
 
260 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 
263 aa  305  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.776253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
260 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.08 
 
 
287 aa  297  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.46 
 
 
260 aa  293  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3564  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
261 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474646  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
259 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783796  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.92 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 
259 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 
259 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.35 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.721085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0275  putative short chain dehydrogenase  51.33 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.599056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.08 
 
 
252 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.1 
 
 
259 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0841499  normal  0.0258312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
252 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
255 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
254 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
273 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
252 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
253 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
253 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
252 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
252 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0997  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.56 
 
 
257 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7091  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  54.72 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162049  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
253 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.580386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
260 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0740781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
257 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
252 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  52.19 
 
 
252 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
252 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.88 
 
 
258 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
252 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
254 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 
259 aa  224  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
255 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
254 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
256 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
252 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
252 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
251 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.718572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1700  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  47.64 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00353062  normal  0.0357096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  49.8 
 
 
252 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
252 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
252 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1684  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
252 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
252 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2720  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  46.56 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
261 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
252 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
252 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7121  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  46.54 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.3 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.228275  normal  0.0798454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
259 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 
252 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00103  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II  51.54 
 
 
256 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34106  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
255 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
254 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0244002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
255 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
262 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4382  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
255 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0363369  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
255 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
255 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0926  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49 
 
 
319 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  49.4 
 
 
252 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2515  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0380  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1079  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
250 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0923  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.61 
 
 
319 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.732955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4554  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
251 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5880  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
255 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.153171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>