More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1504 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.84 
 
 
258 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.750437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.84 
 
 
258 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.406444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
257 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.521861  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
259 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
248 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 
254 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
248 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
254 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
257 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 
254 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
257 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
257 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.98 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
254 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
254 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
247 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  41.53 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.1 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
243 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.982216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
249 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 
252 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
254 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
245 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
260 aa  141  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
260 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
248 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0207781  normal  0.0184598 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.4 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
247 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
251 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
252 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
252 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
253 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
251 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
252 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
255 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
246 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  36.69 
 
 
257 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.4 
 
 
250 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  38 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
265 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
247 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
257 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
255 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4075  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.23 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
252 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
252 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
252 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.96 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  36.92 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
254 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
252 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
233 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
250 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
260 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
250 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
247 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
257 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
248 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
246 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
246 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
247 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
254 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
265 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  131  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
251 aa  131  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
255 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>