106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0269 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0269  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2350  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.57 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.56 
 
 		 509 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  35.56 
 
 		 509 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  35.56 
 
 		 509 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.56 
 
 		 509 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  41.67 
 
 		 647 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  34.41 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  34.41 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  34.41 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  34.41 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  43.08 
 
 		 850 aa  52.4  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  34.41 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 942 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.67 
 
 		 731 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.59 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.59 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1141 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.48 
 
 		 392 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.59 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  43.55 
 
 		 425 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  37.33 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 685 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1877 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.15 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.25 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30 
 
 		 1402 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  44.26 
 
 		 789 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.63 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.81 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  39.34 
 
 		 838 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  34.12 
 
 		 765 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  46.15 
 
 		 117 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  37.93 
 
 		 496 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  37.93 
 
 		 497 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  39.13 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3559  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1493 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  37.93 
 
 		 497 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  37.93 
 
 		 497 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3235  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.54 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.3 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  46.15 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.43 
 
 		 348 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.31 
 
 		 1078 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  41.54 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.59 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.59 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  42 
 
 		 179 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.31 
 
 		 1044 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.94 
 
 		 890 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  34.21 
 
 		 1200 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  34.21 
 
 		 1200 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.58 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1037 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1344 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.85 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  44.23 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  43.1 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.46 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.31 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.9 
 
 		 961 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.67 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0627  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.1 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0876811 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.16 
 
 		 859 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00810  ubiquitin-protein ligase Sel1/Ubx2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14690)  36.47 
 
 		 1121 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.188237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  41.51 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.72 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.38 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1796 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.85 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 865 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  25.84 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.68 
 
 		 831 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  33.33 
 
 		 613 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1281 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.47 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0654  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.36 
 
 		 684 aa  43.5  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.32 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.31 
 
 		 451 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  39.22 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  39.66 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.23 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2484  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  28.21 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>