More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0120 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  85.95 
 
 		 289 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  85.95 
 
 		 289 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  85.95 
 
 		 289 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  85.95 
 
 		 289 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  85.95 
 
 		 289 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  63.06 
 
 		 225 aa  197  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  76.86 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  70.25 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  70.49 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  70.49 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  62.81 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  62.81 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  62.81 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  62.81 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  61.16 
 
 		 283 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  61.98 
 
 		 286 aa  164  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  61.16 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  57.85 
 
 		 267 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  57.85 
 
 		 271 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  57.85 
 
 		 267 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  52.17 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  52.17 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  52.17 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  57.76 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  57.76 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  55.64 
 
 		 309 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  50 
 
 		 276 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  51.24 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  50.41 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  48.76 
 
 		 278 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  48.76 
 
 		 278 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  45.9 
 
 		 250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  47.54 
 
 		 251 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3249  transposase orfB  62.16 
 
 		 85 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  54.32 
 
 		 111 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  47.78 
 
 		 174 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  47.78 
 
 		 174 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 358 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 		 273 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 345 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  39.32 
 
 		 148 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  41.96 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3520  hypothetical protein  77.08 
 
 		 56 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707405 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  34.85 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  29.07 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  34.4 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  34.4 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  34.4 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  34.4 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  34.4 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  41.82 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  30.97 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  34.06 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  34.06 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  34.06 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  34.06 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  34.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  34.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  34.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  34.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  34.06 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  31.61 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  31.61 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  31.61 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  31.61 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  31.61 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  41.67 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  31.82 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  41.9 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  41.9 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  36.07 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>