More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3658 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3658  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  83.11 
 
 
208 aa  261  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  83.11 
 
 
208 aa  261  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  81.76 
 
 
208 aa  256  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  79.73 
 
 
209 aa  254  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  79.05 
 
 
209 aa  254  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  79.05 
 
 
209 aa  253  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  78.91 
 
 
209 aa  248  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  73.65 
 
 
216 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  71.62 
 
 
211 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  72.3 
 
 
216 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  72.3 
 
 
210 aa  229  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  71.62 
 
 
216 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  70.27 
 
 
211 aa  228  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  70.27 
 
 
220 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 
214 aa  227  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 
214 aa  227  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  68.92 
 
 
220 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  66.89 
 
 
211 aa  222  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 
210 aa  221  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  68.92 
 
 
210 aa  220  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  69.59 
 
 
210 aa  220  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  69.59 
 
 
210 aa  220  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  67.57 
 
 
210 aa  219  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  67.57 
 
 
211 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  66.89 
 
 
210 aa  218  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  66.22 
 
 
209 aa  212  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  67.83 
 
 
209 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  64.19 
 
 
205 aa  212  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
215 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
215 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  63.27 
 
 
227 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  64.19 
 
 
211 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  64.34 
 
 
213 aa  207  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
209 aa  207  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
209 aa  207  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
209 aa  205  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  64.19 
 
 
209 aa  204  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  61.22 
 
 
209 aa  204  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
209 aa  203  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  62.94 
 
 
209 aa  203  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  62.94 
 
 
209 aa  203  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
213 aa  202  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
209 aa  201  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
209 aa  200  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
209 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
209 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  60.93 
 
 
214 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
216 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  60.27 
 
 
218 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
209 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  60 
 
 
211 aa  195  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  64.34 
 
 
209 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
209 aa  194  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  59.18 
 
 
209 aa  194  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  59.18 
 
 
209 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
226 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3259  uracil phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
211 aa  191  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  61.38 
 
 
209 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  61.81 
 
 
210 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  186  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  58.45 
 
 
203 aa  185  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
209 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  56.76 
 
 
209 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
207 aa  184  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  58.11 
 
 
208 aa  182  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  56.64 
 
 
209 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  56.64 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
209 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1341  uracil phosphoribosyltransferase  56.08 
 
 
208 aa  181  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.281958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
213 aa  181  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  59.46 
 
 
208 aa  181  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2095  uracil phosphoribosyltransferase  56.76 
 
 
209 aa  180  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 
209 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
209 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  57.97 
 
 
207 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2093  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000398312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  56.85 
 
 
209 aa  177  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1846  Uracil phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
208 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000894444  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 
211 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 
370 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1514  uracil phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
208 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000447278  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
208 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
208 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  52.7 
 
 
208 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>