290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0873 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  55.56 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  58.51 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  54.55 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  40.83 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  49.38 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  38.83 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  44.57 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  45.35 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  46.03 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 479 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 496 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 496 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000869739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  43.04 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  43.84 
 
 		 520 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.0000273847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 524 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3374  Chromosomal replication initiator DnaA domain  43.21 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  43.42 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 		 482 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.56 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.56 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  47.83 
 
 		 477 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 		 506 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 		 472 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 473 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 		 472 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 475 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 472 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 475 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 475 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  42.47 
 
 		 516 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  43.59 
 
 		 506 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  41.1 
 
 		 481 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  42.47 
 
 		 516 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.35 
 
 		 444 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  45.07 
 
 		 494 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  45.07 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  45.07 
 
 		 501 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  37.65 
 
 		 452 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  45.07 
 
 		 499 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  45.07 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.98 
 
 		 458 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 		 498 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  41.1 
 
 		 524 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.65 
 
 		 458 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.63 
 
 		 503 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.57 
 
 		 443 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  35.96 
 
 		 443 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.65 
 
 		 464 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 		 524 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 		 460 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.42 
 
 		 454 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  32.03 
 
 		 440 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  39.73 
 
 		 533 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.43 
 
 		 470 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  49.09 
 
 		 468 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 468 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 462 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 450 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 462 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 445 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.09 
 
 		 464 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 472 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  37.65 
 
 		 470 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 466 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 463 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.09 
 
 		 462 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 533 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.71 
 
 		 481 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 525 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.09 
 
 		 483 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  36.99 
 
 		 482 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.71 
 
 		 481 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 524 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 561 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  49.09 
 
 		 465 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  49.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.54964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>