118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2688 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  68.87 
 
 
151 aa  209  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  68.21 
 
 
151 aa  207  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  58.51 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  40.38 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  45.68 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  37.5 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  54.24 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  41.27 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  50.85 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  41.25 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.36 
 
 
476 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  38.24 
 
 
466 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  38.24 
 
 
464 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  31.37 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.37 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.17 
 
 
452 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.17 
 
 
452 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30 
 
 
503 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.37 
 
 
464 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.56 
 
 
469 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.37 
 
 
461 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  28.95 
 
 
482 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.53 
 
 
476 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  36.08 
 
 
477 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
468 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
463 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
466 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
466 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
466 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  29.41 
 
 
533 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
466 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
466 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  30.39 
 
 
468 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.35 
 
 
454 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.39 
 
 
483 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
472 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
462 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
462 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
450 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.39 
 
 
462 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  31.33 
 
 
467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.61 
 
 
524 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
470 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.86 
 
 
477 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 
460 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.12 
 
 
453 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  22.55 
 
 
459 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  28.43 
 
 
468 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
460 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
460 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
461 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
460 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.58 
 
 
480 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
460 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
457 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  29.21 
 
 
443 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.92 
 
 
509 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
461 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3374  Chromosomal replication initiator DnaA domain  39.08 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.76 
 
 
481 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 
450 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.76 
 
 
481 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  29.76 
 
 
454 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  36.51 
 
 
448 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.79 
 
 
444 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
459 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  27.45 
 
 
461 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.27 
 
 
454 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  26.25 
 
 
455 aa  42  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  33.77 
 
 
460 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.59 
 
 
458 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  36.14 
 
 
494 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
463 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  30 
 
 
460 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.46 
 
 
469 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 
492 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  34.57 
 
 
507 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
473 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  28.83 
 
 
500 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  30.26 
 
 
426 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.45 
 
 
474 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  32.91 
 
 
479 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.87 
 
 
470 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  26.6 
 
 
445 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>