More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0002 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  66.6 
 
 		 481 aa  677    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  65.91 
 
 		 481 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 470 aa  981    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.71 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  44.37 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  44.37 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  43.16 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  42.55 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.28 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.46 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  42.25 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  43.19 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  42.46 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  44.26 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  43.07 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  43.71 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  43.07 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  43.07 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  43.51 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  42.65 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  43.19 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  43.64 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.89 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  43.28 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  43.07 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.28 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  43.83 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.59 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  43.34 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.95 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  43.19 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  43.98 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.9 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.43 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.54 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.14 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  39.37 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  40.85 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  43.62 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  39.17 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  39.61 
 
 		 511 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.28 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.09 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  40.51 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.51 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.56 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  38.8 
 
 		 524 aa  352  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  50.59 
 
 		 514 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.17 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.65 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  48.83 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.7 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.7 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 511 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000189853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  39.35 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  47.04 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.03 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03483  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.84 
 
 		 475 aa  332  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  38.74 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.58 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.27 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.58 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.81 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.02 
 
 		 474 aa  320  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  36.44 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  37.23 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 		 524 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.26 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  36.84 
 
 		 468 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.98 
 
 		 464 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.789649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  37.08 
 
 		 473 aa  315  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.02 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.74 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  36.04 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>