More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0001 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 496 aa  1010    Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  70.19 
 
 		 481 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  69.09 
 
 		 516 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  99.8 
 
 		 496 aa  1007    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000869739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  67.7 
 
 		 479 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  67.01 
 
 		 524 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  69.64 
 
 		 524 aa  673    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  69.57 
 
 		 516 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  92.54 
 
 		 520 aa  873    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.0000273847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  51.12 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  50.92 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  51.12 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  49.49 
 
 		 475 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  49.49 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  48.68 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  49.19 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 		 498 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  48.47 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  46.9 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  48.09 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  46.07 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  45.25 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.06 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 		 482 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  40.46 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  38.65 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  36.72 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  38.4 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  38.29 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.27 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.21 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.96 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  35.08 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.08 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.17 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  35.64 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.51 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.9 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.16 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.64 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  37.63 
 
 		 487 aa  286  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  34.01 
 
 		 451 aa  286  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.72 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.64 
 
 		 474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 		 457 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.81 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  33.68 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.96 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  33.68 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.96 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  32.58 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.24 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  40.87 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  33.13 
 
 		 445 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.2 
 
 		 498 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 		 452 aa  267  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.04 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.29 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.46 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.84 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.7 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.87 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.46 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.54 
 
 		 464 aa  263  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.61 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.2 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.15 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.8 
 
 		 516 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.97 
 
 		 463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>